- Staurophora mertensii
- Steenstrupiella pozzi
- Steenstrupiella steenstrupii
- Stegosoma magnum
- Stelidiella stelidium
- Stenocionops furcatus coelatus
- Stenocionops spinimana
- Stenocionops spinosissima
- Stenopleura atlantica
- Stenorhynchus seticornis
- Stenosemella avellana
- Stentor polymorphus
- Stepanjantsia polymorpha
- Sthenoteuthis pteropus
- Stichopilium bicorne
- Stomolophus meleagris
- Streetsia challengeri
- Streetsia mindanaonis
- Streetsia palmaspinosa
- Streetsia porcella
- Streetsia steenstrupi
- Strobilidium typicum
- Strombidium antarcticum
- Strombidium compressum
- Strombidium conicoides
- Strombidium conicum
- Strombidium crassulum
- Strombidium diversum
- Strombidium sulcatum
- Stygiomedusa gigantea
- Stylatractus spp.
- Stylicauda platensis
- Styliola subula
- Stylocheiron abbreviatum
- Stylocheiron affine
- Stylocheiron carinatum
- Stylocheiron elongatum
- Stylocheiron longicorne
- Stylocheiron maximum
- Stylocheiron micropthalma
- Stylocheiron robustum
- Stylocheiron suhmii
- Stylochlamydium asteriscus
- Stylodictya aculeata
- Stylodictya multispina
- Stylosphaera melpomene
- Styptosphaera spumacea
- Subeucalanus crassus
- Subeucalanus longiceps
- Subeucalanus monachus