- Dairella latissima
- Danaella mimonectes
- Daturella datura
- Daturella emarginata
- Deepstaria enigmatica
- Deilocerus analogus
- Deilocerus perpusillus
- Delius nudus
- Delius sewelli
- Dentagloborotalia anfracta
- Desmonema chierchianum
- Desmonema gaudichaudi
- Desmopterus papilio
- Diacavolinia angulosa
- Diacavolinia atlantica
- Diacavolinia bicornis
- Diacavolinia constricta
- Diacavolinia deblainvillei
- Diacavolinia deshayesi
- Diacavolinia elegans
- Diacavolinia limbata africana
- Diacavolinia limbata limbata
- Diacavolinia longirostris
- Diacavolinia ovalis
- Diacavolinia robusta
- Diacavolinia strangulata
- Diacria danae
- Diacria major
- Diacria rampali
- Diacria trispinosa trispinosa
- Diaixis helenae
- Diaixis hibernica
- Diaixis hibernica tropica
- Diaixis trunovi
- Dicranophora buetschli
- Dictyacantha tabulata
- Dictyacantha tetragonopa
- Dictyaspis furcata
- Dictyaspis solidissima
- Dictyocephalus papillosus
- Dictyocoryne profunda
- Dictyocoryne truncatum
- Dictyocysta californiensis
- Dictyocysta duplex
- Dictyocysta elegans
- Dictyocysta mitra
- Dictyophimus gracilipes
- Dictyophimus hirundo
- Dictyophimus infabricatus
- Didinium gargantua